http://www.virustotal.com/ru/
самая комплексная. делает проверку файла кучей антивирусов.

http://online.us.drweb.com/
доктор вэб он и в африке доктор вэб.

http://www.kaspersky.ru/virusscanner
всем известная контора, но есть ограничение на размер проверяемого файла 1мб.
http://www.pandasecurity.com/activescan/index/
неплохой комплесный сервер от известного антивируса. проверяет как отдельные файлы, так и весь комп целиком дотошно, либо по быстрому. можно без регистрации можно и зарегистрироваться.
работает только с Internet Explorer (6 или позднее) или Mozilla Firefox (1.5 или позднее). и права на установку ActiveX.
